MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens TA208 chromosome

Total Repeats: 84700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017188	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017188	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017188	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017188	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017188	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017188	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017188	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017188	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017188	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017188	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017188	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	384157613
12	NC_017188	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
13	NC_017188	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	384157613
14	NC_017188	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	384157613
15	NC_017188	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
16	NC_017188	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
17	NC_017188	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384157613
18	NC_017188	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
19	NC_017188	TTTA	3	12	849	860	25 %	75 %	0 %	0 %	384157613
20	NC_017188	G	7	7	862	868	0 %	0 %	100 %	0 %	384157613
21	NC_017188	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384157613
22	NC_017188	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
23	NC_017188	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157613
24	NC_017188	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
25	NC_017188	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	384157613
26	NC_017188	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
27	NC_017188	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	384157613
28	NC_017188	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157613
29	NC_017188	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	384157613
30	NC_017188	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157613
31	NC_017188	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
32	NC_017188	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157613
33	NC_017188	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
34	NC_017188	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
35	NC_017188	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
36	NC_017188	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	384157613
37	NC_017188	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
38	NC_017188	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
39	NC_017188	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
40	NC_017188	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
41	NC_017188	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	384157613
42	NC_017188	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157613
43	NC_017188	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017188	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017188	T	6	6	1894	1899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017188	AT	3	6	1903	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017188	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017188	AGG	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017188	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
50	NC_017188	TCAT	2	8	2100	2107	25 %	50 %	0 %	25 %	384157614
51	NC_017188	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157614
52	NC_017188	CGAT	2	8	2140	2147	25 %	25 %	25 %	25 %	384157614
53	NC_017188	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
54	NC_017188	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
55	NC_017188	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	384157614
56	NC_017188	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384157614
57	NC_017188	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
58	NC_017188	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
59	NC_017188	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
60	NC_017188	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
61	NC_017188	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
62	NC_017188	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
63	NC_017188	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
64	NC_017188	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
65	NC_017188	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
66	NC_017188	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	384157614
67	NC_017188	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
68	NC_017188	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
69	NC_017188	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
70	NC_017188	GCTG	2	8	2885	2892	0 %	25 %	50 %	25 %	384157614
71	NC_017188	TTCA	2	8	2921	2928	25 %	50 %	0 %	25 %	384157614
72	NC_017188	AT	3	6	2936	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	384157614
73	NC_017188	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
74	NC_017188	AAAC	2	8	3073	3080	75 %	0 %	0 %	25 %	384157614
75	NC_017188	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017188	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017188	CAAG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017188	T	6	6	3166	3171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017188	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157615
80	NC_017188	GAGC	2	8	3315	3322	25 %	0 %	50 %	25 %	384157615
81	NC_017188	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157615
82	NC_017188	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157615
83	NC_017188	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157615
84	NC_017188	GC	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	384157616
85	NC_017188	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157616
86	NC_017188	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384157616
87	NC_017188	GAAG	2	8	3655	3662	50 %	0 %	50 %	0 %	384157616
88	NC_017188	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
89	NC_017188	A	6	6	3709	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	384157616
90	NC_017188	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
91	NC_017188	TCAG	2	8	3755	3762	25 %	25 %	25 %	25 %	384157616
92	NC_017188	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384157616
93	NC_017188	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384157616
94	NC_017188	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
95	NC_017188	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384157616
96	NC_017188	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157616
97	NC_017188	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
98	NC_017188	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	384157616
99	NC_017188	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
100	NC_017188	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
101	NC_017188	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157616
102	NC_017188	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
103	NC_017188	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
104	NC_017188	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157616
105	NC_017188	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384157616
106	NC_017188	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157617
107	NC_017188	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157617
108	NC_017188	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
109	NC_017188	GACA	2	8	4677	4684	50 %	0 %	25 %	25 %	384157617
110	NC_017188	GAAA	2	8	4685	4692	75 %	0 %	25 %	0 %	384157617
111	NC_017188	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157617
112	NC_017188	CCGT	2	8	4701	4708	0 %	25 %	25 %	50 %	384157617
113	NC_017188	AT	4	8	4747	4754	50 %	50 %	0 %	0 %	384157617
114	NC_017188	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
115	NC_017188	AT	3	6	4837	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017188	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
117	NC_017188	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
118	NC_017188	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157618
119	NC_017188	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
120	NC_017188	CGGT	2	8	5118	5125	0 %	25 %	50 %	25 %	384157618
121	NC_017188	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
122	NC_017188	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
123	NC_017188	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
124	NC_017188	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
125	NC_017188	TCAT	2	8	5592	5599	25 %	50 %	0 %	25 %	384157618
126	NC_017188	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384157618
127	NC_017188	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
128	NC_017188	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157618
129	NC_017188	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
130	NC_017188	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	384157618
131	NC_017188	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
132	NC_017188	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
133	NC_017188	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
134	NC_017188	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
135	NC_017188	A	6	6	6044	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	384157618
136	NC_017188	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
137	NC_017188	GCGG	2	8	6170	6177	0 %	0 %	75 %	25 %	384157618
138	NC_017188	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384157618
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270	NC_017188	T	8	8	12581	12588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017188	TGT	2	6	12614	12619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017188	ATGA	2	8	12666	12673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_017188	TTCGGC	2	12	19812	19823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157627
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